Строительство центра стало возможным благодаря долгосрочной целевой программе Архангельской области «Демографическое развитие и здоровое поколение на 2009-2010 годы». Средства программы направлялись на оснащение лечебно-диагностическим, в том числе реанимационным оборудованием отделений областной детской клинической больницы, отделения неонатологии областной клинической больницы, на ремонт отделений АОДКБ, обеспечение дорогостоящими лекарствами и лечебным питанием юных пациентов больницы.
Всего из федерального и областного бюджетов на финансирование программы было направлено более 61 миллион рублей. Начиная с текущего года, мероприятия по демографическому развитию и формированию здорового образа жизни у детей включены в проект программы модернизации здравоохранения Поморья.